大阪大学・生命機能数理モデル検討会

Study Sessions on Mathematical Modeling in Biology and Related Topics

生命システムの数理モデル化に興味を持つ様々な分野の研究者による勉強会を開催しています。毎月一度、関連する分野の研究者を講師に招いて研究発表をして頂き、生命システムの様々な数理モデル化のアプローチを勉強しています。また、セミナー後にはディスカッションの時間を設け、同様のアプローチを他の生命システムへ、特に免疫システムへ応用できないか?数理モデル化のボトルネックになる問題点は何か?など、活発な議論を行っています。集まっている研究者は大阪大学の研究者が中心で、分子生物学、数理生物学、物理学、工学など様々なバックグラウンドを持った研究者間で意見を交換し合う分野横断的な集まりとなっています。 オープンな勉強会ですので、どなたでもご参加頂けます。

(2015年7月より、英語による姉妹勉強会 『Study Sessions on Bioinformatics and Related Topics』(大阪大学・バイオインフォマティクス検討会) を始めました。こちらのセミナー情報はこのホームページにも掲載予定です。)

特に指定がない限り
曜日:水
時間:10:00-12:00
場所:大阪大学免疫学フロンティア研究センター(IFReC) IFReC棟2階会議室1
言語:日本語 (青い背景の回は 『Study Sessions on Bioinformatics and Related Topics』 で英語です。)
日時、場所 講演者 アブスト タイトル
第50回 2016年9月28日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
備瀬 竜馬 氏
(国立情報学研究所)
こちら 密な細胞画像を対象とした細胞トラッキング手法
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第49回 2016年8月24日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
内田 誠一 氏
(九州大学、システム情報科学研究院)
こちら 動的計画法の基礎と応用 ~色々使える大局的最適化法
こちら
Bioinfo 6. 2016年7月27日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
岡田 随象 氏
(大阪大学 大学院医学系研究科)
こちら Genotype imputation
第48回 2016年7月13日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
本田 直樹 氏
(京都大学、医学研究科)
こちら Decoding of intracellular signal transfer from FRET imaging
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神経成長円錐の走化性によるトポグラフィックな軸索投射の数理モデル
Bioinfo 5. 2016年6月29日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
川路 英哉 氏
(理化学研究所、情報基盤センター)
こちら Precise annotation of TSS peaks uncovering complexity in state-dependent activation of transcription initiation
第47回 2016年5月25日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
荒田 幸信 氏
(理化学研究所)
こちら 1分子検出技術を用いた精密定量計測による発生生物学
第46回 2016年4月13日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
岡田 康志 氏
(理化学研究所、QBiC)
こちら 分子モーターは細胞内で何故迷子にならないのか
~正の協同性による自己組織化モデルの一般性について~
第45回 2016年3月9日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
谷口 雄一 氏
(理化学研究所、QBiC)
こちら 1細胞内多階層オミックス動態の連関性
第44回 2016年2月17日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
杉村 薫 氏
(京都大学 物質細胞統合システム拠点)
こちら Dissecting the mechanical control of Drosophila wing shape determination
Bioinfo 4. 2016年2月3日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
竹中 要一 氏
(大阪大学)
こちら Detect the time point when organisms toggle gene regulatory networks from their expression profiles
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第43回 2015年11月25日(水)
10:00~
IFReC棟7階704号室
木森 義隆 氏
(自然科学研究機構新分野創成センター)
こちら 数理形態学に基づく画像情報の抽出と定量化
Bioinfo 3. 2015年11月4日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
山西 芳裕 氏
(九州大学)
こちら Systematic drug repositioning for a wide range of diseases with machine learning methods
第42回 2015年10月28日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
鈴木 誉保 氏
(農業生物資源研究所)
こちら 数学をつかって理解する蝶や蛾の擬態模様
Bioinfo 2. 2015年9月9日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
小寺 正明 氏
(東京工業大学、生命理工学部)
こちら Metabolome-scale de novo pathway reconstruction using regioisomer-sensitive graph alignments
第41回 2015年7月16日(木)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
Larry Manevitz 氏
(Department of Computer Science, University of Haifa, Israel)
こちら Some elements of One Class Learning and Neurocomputation (in English)
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Bioinfo 1. 2015年7月8日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
瀬々 潤 氏
(AIST)
こちら Statistical significance for untangling complex genotype-phenotype connections
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番外 2015年7月2日(木)
16:00~
IFReC棟2階会議室1
高部 英明 氏
(大阪大学レーザーエネルギー学研究センター)
大学進化論と研究者進化論
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第40回 2015年6月17日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
真鍋 勇一郎 氏
(大阪大学、工学研究科)
こちら 放射線生体影響の定量評価を可能にする数理モデル
第39回 2015年5月13日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
東 俊一 氏
(京都大学、情報学研究科)
こちら 制御工学と生物システム
第38回 2015年3月4日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
小山 宏史 氏
(基礎生物学研究所、発生生物学領域)
マウス卵管における管腔上皮のヒダのパターン形成の力学的機構
~ヒダのパターンと平面内細胞極性との関係について~
第37回 2015年2月18日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
石本 志高 氏
(理化学研究所、QBiC)
Bubbly vertex dynamics: a dynamical and geometrical model for epithelial tissues with curved cell shapes
第36回 2015年1月21日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
大羽 成征 氏
(京都大学 情報学研究科)
経験ベイズ検定による偽陽性制御の方法とその応用
第35回 2014年12月24日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
海津 一成 氏
(理化学研究所、QBiC)
細胞内で分子はどこまで正確に情報を伝えられるのか
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第34回 2014年11月26日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
田中 冬彦 氏
(大阪大学大学院基礎工学研究科)
時系列モデルの無情報事前分布 ~理論的な観点から~
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第33回 2014年10月22日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
宇田 新介 氏
(九州大学生体防御医学研究所)
情報理論を用いた細胞内シグナル伝達の解析
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第32回 2014年9月24日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
西本 伸志 氏
(CiNet)
予測モデル構築を介したヒト脳内表象の理解と可視化
第31回 2014年8月20日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
瀬尾 茂人 氏
(大阪大学大学院情報科学研究科)
バイオイメージングデータからのデータマイニング
第30回 2014年7月9日(水)
10:00~
IFReC棟2階会議室1
小林 徹也 氏
(東京大学 生産技術研究所)
情報からとらえる生命現象
第29回 2014年6月11日(水) 10:00~
IFReC棟2階会議室1
Ben Seymour 氏
(CiNet/IFReC)
Pain: prediction and control (in English)
第28回 2014年5月28日(水) 10:00~
IFReC棟2階会議室1
徳永 旭将 氏
(統計数理研究所 データ同化研究開発センター)
バイオイメージ解析におけるベイズ統計の応用
第27回 2014年4月23日(水) 10:00~
IFReC棟2階会議室1
下平 英寿 氏
(大阪大学大学院基礎工学研究科)
ブートストラップ法による信頼度計算
~遺伝子発現のクラスタリングや分子進化の系統樹を例としてベイズ事後確率とp値の関係を探る~
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第26回 2014年3月12日(水) 10:00~
IFReC棟2階会議室1
藤本 久貴 氏
(大阪大学医学研究科)
文法情報の神経内コーディング -高次機能が脳内でどう扱われてるか-
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第25回 2014年2月19日(水) 10:00~
IFReC棟2階会議室1
戸村 道夫 氏
(京都大学医学研究科 次世代免疫制御を目指す創薬医学融合拠点)
免疫細胞の時間・空間・数量的な全身レベルの動態情報に基づく免疫システムの理解
第24回 2014年1月15日(水) 10:00~
IFReC棟2階会議室1
平田 祥人 氏
(東京大学 生産技術研究所 最先端数理モデル連携研究センター)
前立腺癌ホルモン療法の数理モデリング:臨床応用に向けて
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第23回 2013年12月18日(水) 10:00~
IFReC棟2階会議室1
吉田 亮 氏
(情報・システム研究機構 統計数理研究所 モデリング研究系)
ベイズ統計学入門:システムズバイオロジー、分子設計、バイオイメージングの応用例を中心に
An Introduction to Bayesian statistics: Applications to systems biology, molecular design problem and bioimageinformatics
第22回 2013年10月16日(水) 10:00~
IFReC棟2階会議室1
細田 一史 氏
(大阪大学未来戦略機構、情報科学研究科)
B級モデルは役に立つか?細胞サイズ・シグナル・免疫・機械制御・生態系を例に
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第21回 2013年9月18日(水) 10:00~
IFReC棟2階会議室1
寺前 順之介 氏
(大阪大学大学院情報科学研究科 バイオ情報工学専攻)
脳の自発揺らぎの数理科学:その起源と神経情報処理における役割
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第20回 2013年8月21日(水) 10:00~
IFReC棟2階会議室1
中根 和昭 氏
(大阪大学大学院医学系研究科保健学専攻)
位相数学を用いた組織分析法について
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第19回 2013年7月10日(水) 10:00~
IFReC棟2階会議室1
古澤 力 氏
(理化学研究所、QBiC)
細胞分化の動的モデル  ~幹細胞システムの理解へ向けて~
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第18回 2013年6月26日(水) 10:00~
IFReC棟2階会議室1
佐伯 晃一 氏
(総合研究大学院大学)
Consideration of TCR cross-reactivity and role of regulatory T cells
第17回 2013年5月15日(水) 10:00~
IFReC棟2階会議室1
高木 拓明 氏
(奈良県立医科大学 物理学教室)
細胞の自発運動と走性情報処理
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第16回 2013年4月24日(水) 10:00~
IFReC棟2階会議室1
中岡 慎治 氏
(理研免疫・アレルギー科学総合センター 免疫数理モデリング研究)
表皮における初期炎症反応ダイナミクスの確率シミュレーション研究
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第15回 2013年3月6日(水) 10:00~
IFReC棟2階会議室1
冨樫 祐一 氏
(神戸大学 大学院システム情報学研究科 計算科学専攻)
細胞内反応ネットワークと「少数性」効果
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第14回 2013年2月27日(水) 10:00~
IFReC棟2階会議室1
近藤 洋平 氏
(東京大学大学院 総合文化研究科 広域科学専攻相関基礎科学系)
時系列解析によって抽出される細胞シグナル伝達の動力学
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第13回 2013年1月30日(水) 10:00~
IFReC棟2階会議室1
中村 和幸 氏
(明治大学大学院 先端数理科学研究科 先端数理科学インスティテュート)
統計的時系列解析とデータ同化: モデルとデータを融合して知識を見つけるアプローチ
第12回 2012年11月28日(水) 10:00~
IFReC棟2階会議室1
岩見 真吾 氏
(九州大学大学院 理学研究院)
計算ウイルス学・免疫学の展開
第11回 2012年10月24日(水) 10:00~
IFReC棟2階会議室1
柴田 達夫 氏
(理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター)
走化性細胞における自発的な極性形成と走化性応答に、実験と理論からアプローチする
第10回 2012年9月26日(水) 10:00~
IFReC棟404号室
四方 哲也 氏
(大阪大学 情報科学研究科 バイオ情報工学専攻)
遺伝子発現の確率性とその生物学的意義
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第9回 2012年8月8日(水) 10:00~
IFReC棟404号室
齋藤 卓 氏
(大阪大学 工学研究科 システム創成専攻数理科学領域)
がんの浸潤・転移に関わる分子パスウェイの阻害解析
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第8回 2012年7月18日(水) 10:00~
IFReC棟404号室
浅田 稔 氏、森 裕紀 氏
(大阪大学 工学研究科 知能・機能創生工学)
認知発達ロボティクスの挑戦:胎児・新生児の脳・身体発達シミュレーションを例に
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番外 2012年7月18日(水) 9:30~
IFReC棟404号室
寺口 俊介 氏
(大阪大学IFReC)
バイオの方にもわかる(!?)ヒッグス粒子の話
第7回 2012年6月20日(水) 10:00~
IFReC棟404号室
青木 一洋 氏
(京都大学 生命科学研究科 生体制御学)
細胞内情報伝達系の定量解析
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第6回 2012年5月9日(水) 10:00~
IFReC棟404号室
松岡 里実 氏
(理化学研究所 QBiC 細胞シグナル動態研究グループ)
確率的生体分子による細胞内自己組織化
第5回 2012年4月11日(水) 10:00~
IFReC棟404号室
森下 喜弘 氏
(理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター)
発生過程における組織変形の幾何学的解析と空間情報のコーディングデザイン(II)
第4回 2012年3月14日(水) 10:00~
IFReC棟404号室
森下 喜弘 氏
(理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター)
発生過程における組織変形の幾何学的解析と空間情報のコーディングデザイン(I)
第3回 2012年2月15日(水) 10:00~
IFReC棟404号室
作村 諭一 氏
(奈良先端大・バイオサイエンス)
ランダム事象が生み出す神経極性: 定量数理モデルの解析
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第2回 2012年1月11日(水) 10:00~
IFReC棟404号室
藤本 仰一 氏
(阪大・理・生物科学)
細胞の集団的振る舞いの始まり方
第1回 2011年12月21日(水) 11:00~
IFReC棟404号室
時田 恵一郎 氏
(大阪大学サイバーメディアセンター)
Theory of Biological Networks
第1回 2011年12月21日(水) 10:00~
IFReC棟404号室
寺口 俊介 氏
(大阪大学IFReC)
自然免疫学と数理モデル
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英語による姉妹勉強会:『Study Sessions on Bioinformatics and Related Topics』(大阪大学・バイオインフォマティクス検討会)

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